Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
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