Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PEX6Q13608 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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PEX6Q13608 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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PEX6Q13608 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
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PEX6Q13608 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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PEX6Q13608 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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PEX6Q13608 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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PEX6Q13608 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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