Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNW1Q13573 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms