Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R1AQ13522 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R1AQ13522 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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