Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATMQ13315 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATMQ13315 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATMQ13315 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATMQ13315 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATMQ13315 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ATMQ13315 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATMQ13315 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATMQ13315 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATMQ13315 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATMQ13315 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATMQ13315 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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