Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms