Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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