Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms