Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms