Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms