Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms