Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 RPF1YHR088W 888 nt0.93□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 CDC39YCR093W 6327 nt0.93□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 ZIP1YDR285W 2628 nt0.92□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 MXR1YER042W 555 nt0.92□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 BIG1YHR101C 1008 nt0.92□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YLR269CYLR269C 351 nt0.92□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.92□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 PBI2YNL015W 228 nt0.92□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YPR153WYPR153W 423 nt0.92□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 BEM2YER155C 6504 nt0.92□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 MKT1YNL085W 2493 nt0.91□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.91□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.91□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.91□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 snR14snR14 160 nt0.91□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 SGO1YOR073W 1773 nt0.91□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 SCC2YDR180W 4482 nt0.9□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YCR001WYCR001W 315 nt0.9□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.9□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 YPR063CYPR063C 423 nt0.9□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 SMC1YFL008W 3678 nt0.9□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 SPO23YBR250W 1572 nt0.89□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 URM1YIL008W 300 nt0.89□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 RPL9BYNL067W 576 nt0.89□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 RPL32YBL092W 393 nt0.89□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 ROM2YLR371W 4071 nt0.89□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 VPS54YDR027C 2670 nt0.89□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 PXA2YKL188C 2562 nt0.89□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 LYS14YDR034C 2373 nt0.89□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 MUK1YPL070W 1839 nt0.88□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.87□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 YGL239CYGL239C 315 nt0.87□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 RPL16AYIL133C 600 nt0.87□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 YLL020CYLL020C 306 nt0.87□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.87□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 CDC33YOL139C 642 nt0.87□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 DOP1YDR141C 5097 nt0.87□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 PIG1YLR273C 1947 nt0.87□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 YLL054CYLL054C 2532 nt0.86□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 RTR1YER139C 681 nt0.86□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 YGR290WYGR290W 444 nt0.86□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 PHS1YJL097W 654 nt0.86□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 HIT1YJR055W 495 nt0.86□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 NFU1YKL040C 771 nt0.86□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 YML108WYML108W 318 nt0.86□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 HCH1YNL281W 462 nt0.86□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 NUT2YPR168W 474 nt0.86□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 YDR114CYDR114C 303 nt0.85□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 AIM29YKR074W 468 nt0.85□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 RUF22RUF22 515 nt0.85□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 SEC3YER008C 4011 nt0.85□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 IFH1YLR223C 3258 nt0.84□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 TTI1YKL033W 3117 nt0.84□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 SPT21YMR179W 2277 nt0.84□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 PRE4YFR050C 801 nt0.84□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 NBL1YHR199C-A 222 nt0.84□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 ERP4YOR016C 624 nt0.84□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 snR189snR189 189 nt0.84□□□□□ -2.27
NEJ1Q06148 NOC3YLR002C 1992 nt0.84□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 SWI4YER111C 3282 nt0.83□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 PIP2YOR363C 2991 nt0.83□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.83□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YGR045CYGR045C 363 nt0.83□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 RTT102YGR275W 474 nt0.83□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.83□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 FYV7YLR068W 456 nt0.83□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.83□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.83□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.83□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.83□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 EAF1YDR359C 2949 nt0.83□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 NUT1YGL151W 3399 nt0.83□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 SWI6YLR182W 2412 nt0.83□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YLL032CYLL032C 2478 nt0.82□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YHR130CYHR130C 336 nt0.82□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 MRPL31YKL138C 396 nt0.82□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 SDH2YLL041C 801 nt0.82□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YNL122CYNL122C 348 nt0.82□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YNL303WYNL303W 348 nt0.82□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 PAU24YBR301W 363 nt0.82□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 STB6YKL072W 2301 nt0.82□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 APL3YBL037W 3078 nt0.82□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.81□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YHR125WYHR125W 306 nt0.81□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 RFX1YLR176C 2436 nt0.81□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 SCW11YGL028C 1629 nt0.81□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 MPT5YGL178W 2580 nt0.81□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 ENV11YGR071C 2583 nt0.81□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YDR269CYDR269C 324 nt0.8□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 CYC7YEL039C 342 nt0.8□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.8□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 BI2Q0110 1272 nt0.8□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.8□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.79□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YIL059CYIL059C 366 nt0.79□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 YPL182CYPL182C 384 nt0.79□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 KAP120YPL125W 3099 nt0.78□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 SAS3YBL052C 2496 nt0.78□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 WIP1YDR374W-A 270 nt0.78□□□□□ -2.28
NEJ1Q06148 UPS1YLR193C 528 nt0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.8 ms