Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms