Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms