Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN10P78369 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms