Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RHBDL3P58872 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms