Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACLYP53396 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACLYP53396 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACLYP53396 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACLYP53396 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACLYP53396 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACLYP53396 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACLYP53396 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACLYP53396 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACLYP53396 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACLYP53396 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACLYP53396 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACLYP53396 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACLYP53396 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACLYP53396 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACLYP53396 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACLYP53396 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACLYP53396 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACLYP53396 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACLYP53396 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACLYP53396 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACLYP53396 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACLYP53396 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACLYP53396 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACLYP53396 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACLYP53396 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACLYP53396 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACLYP53396 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACLYP53396 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACLYP53396 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms