Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9AP51151 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms