Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA8P48165 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA8P48165 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA8P48165 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA8P48165 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA8P48165 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA8P48165 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA8P48165 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA8P48165 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA8P48165 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA8P48165 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA8P48165 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA8P48165 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA8P48165 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA8P48165 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms