Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXLNAP40222 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXLNAP40222 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms