Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHC1P29353 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SHC1P29353 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHC1P29353 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHC1P29353 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHC1P29353 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHC1P29353 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHC1P29353 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHC1P29353 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHC1P29353 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHC1P29353 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHC1P29353 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHC1P29353 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms