Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4AP27815 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms