Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms