Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GCSHP23434 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GCSHP23434 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GCSHP23434 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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