Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC3P19447 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms