Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms