Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPBP14678 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPBP14678 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms