Protein–RNA interactions for Protein: P14317

HCLS1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1P14317 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCLS1P14317 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCLS1P14317 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms