Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms