Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EGFRP00533 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EGFRP00533 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EGFRP00533 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EGFRP00533 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EGFRP00533 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EGFRP00533 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EGFRP00533 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EGFRP00533 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EGFRP00533 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EGFRP00533 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EGFRP00533 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EGFRP00533 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EGFRP00533 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EGFRP00533 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EGFRP00533 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EGFRP00533 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EGFRP00533 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EGFRP00533 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EGFRP00533 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EGFRP00533 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EGFRP00533 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EGFRP00533 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EGFRP00533 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EGFRP00533 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EGFRP00533 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EGFRP00533 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EGFRP00533 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EGFRP00533 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EGFRP00533 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EGFRP00533 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EGFRP00533 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EGFRP00533 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EGFRP00533 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EGFRP00533 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EGFRP00533 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EGFRP00533 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EGFRP00533 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EGFRP00533 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EGFRP00533 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EGFRP00533 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms