Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms