Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLOT1O75955 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms