Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms