Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRY3O43610 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms