Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms