Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF6O14896 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF6O14896 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF6O14896 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF6O14896 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF6O14896 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF6O14896 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF6O14896 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF6O14896 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF6O14896 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF6O14896 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF6O14896 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF6O14896 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF6O14896 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF6O14896 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF6O14896 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF6O14896 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF6O14896 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF6O14896 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF6O14896 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF6O14896 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF6O14896 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF6O14896 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF6O14896 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF6O14896 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF6O14896 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF6O14896 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF6O14896 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF6O14896 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF6O14896 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF6O14896 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF6O14896 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF6O14896 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF6O14896 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF6O14896 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF6O14896 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRF6O14896 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF6O14896 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF6O14896 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms