Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms