Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRIQ3A6PVS8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms