Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TARSL2A2RTX5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TARSL2A2RTX5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TARSL2A2RTX5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TARSL2A2RTX5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TARSL2A2RTX5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TARSL2A2RTX5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TARSL2A2RTX5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TARSL2A2RTX5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms