Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LPAR6-202ENST00000378434 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SP110-215ENST00000540870 2032 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 HERC2P5-201ENST00000562687 3825 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 BTF3L4-202ENST00000472944 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL445231.1-201ENST00000445523 1814 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL590999.1-201ENST00000607675 3776 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ANKRD55-202ENST00000434982 1518 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SOX9-AS1-217ENST00000623935 1563 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 IL12B-201ENST00000231228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NCAPH-201ENST00000240423 2763 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 VIT-202ENST00000379242 2810 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AP002358.1-201ENST00000399003 2805 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LANCL1-201ENST00000233714 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SND1-IT1-201ENST00000623342 2481 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NOS2P3-202ENST00000458685 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PSMD10-205ENST00000372295 779 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RCL1-201ENST00000381728 758 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CFAP61-207ENST00000389656 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RNA5SP221-201ENST00000411271 103 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL359475.1-201ENST00000414505 292 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZRANB2-AS2-203ENST00000415780 249 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NIF3L1-206ENST00000416651 967 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC00316-201ENST00000416722 455 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RPS23P8-201ENST00000429775 330 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL032821.1-201ENST00000430895 581 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SRGAP3-AS3-201ENST00000432981 1223 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL391987.3-201ENST00000441101 719 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC005099.1-201ENST00000442083 610 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC01713-201ENST00000445589 932 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC125618.1-201ENST00000472596 563 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RN7SL448P-201ENST00000475566 295 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 IGKV1-16-201ENST00000479981 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RN7SL28P-201ENST00000488836 298 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC01944-201ENST00000517916 416 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CCAR2-208ENST00000521301 337 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ADAM2-205ENST00000521880 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 IGHVII-30-1-201ENST00000522218 301 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AP003354.1-201ENST00000523791 533 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC008619.1-201ENST00000524312 567 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC055716.1-201ENST00000550077 495 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NUTF2P6-201ENST00000560892 385 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL157931.1-201ENST00000575845 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC005722.3-201ENST00000580884 446 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC090213.1-201ENST00000586841 546 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC243960.5-201ENST00000597858 255 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC174071.1-201ENST00000603069 517 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC119619.1-201ENST00000619728 112 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 snoMe28S-Am2634.2-201ENST00000637869 80 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 IKZF3-205ENST00000350532 1413 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 IKZF3-206ENST00000351680 1413 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 KIF6-208ENST00000538893 2386 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AKAP3-206ENST00000545990 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 TBX5-AS1-201ENST00000528549 3620 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 HMSD-201ENST00000408945 2101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ANKS1B-215ENST00000549493 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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