Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP3Q9Y6F1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
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