Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms