Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms