Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms