Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF20Q9UGU0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCF20Q9UGU0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms