Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms