Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 ORC6-203ENST00000563599 681 ntTSL 514.88□□□□□ -0.037e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.72□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.097e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.137e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 SMOC1-204ENST00000555917 570 ntTSL 413.43□□□□□ -0.267e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 KCNMB3-204ENST00000392686 2055 ntTSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 WDR45B-202ENST00000571767 789 ntTSL 212.75□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 CDCA7-205ENST00000435616 928 ntTSL 312.66□□□□□ -0.387e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 CDCA7-208ENST00000496441 2943 ntTSL 211.74□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 IFT140-202ENST00000397417 4023 ntTSL 511.55□□□□□ -0.567e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 CDCA7-204ENST00000410101 1369 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 UBAP2-203ENST00000379235 2673 ntTSL 1 (best)11.07□□□□□ -0.647e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 WDR20-220ENST00000561154 541 ntTSL 411.07□□□□□ -0.647e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 WDR20-210ENST00000556511 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.657e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 WDR20-216ENST00000558567 586 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.667e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 EGF-201ENST00000265171 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.677e-7■■■■■ 27.3
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RBM22Q9NW64 KCNMB3-207ENST00000497599 1004 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.77e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 RNF144A-203ENST00000432850 805 ntTSL 310.5□□□□□ -0.737e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 WDR20-207ENST00000555879 2175 ntTSL 210.43□□□□□ -0.747e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 CDCA7-206ENST00000467411 3176 ntTSL 1 (best)10.38□□□□□ -0.757e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.757e-7■■■■■ 27.3
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RBM22Q9NW64 WDR20-201ENST00000299135 2198 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.877e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 CDK2AP1-206ENST00000544658 931 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.877e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 WDR20-206ENST00000454394 2067 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.897e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 EGF-206ENST00000509793 4489 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.917e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 WDR20-212ENST00000557186 631 ntTSL 38.98□□□□□ -0.977e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.987e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 WDR45B-204ENST00000571835 869 ntTSL 58.89□□□□□ -0.997e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 EGF-204ENST00000503392 3642 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.027e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 SMYD3-208ENST00000464398 540 ntTSL 38.24□□□□□ -1.097e-7■■■■■ 27.3
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RBM22Q9NW64 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.147e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.197e-7■■■■■ 27.3
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RBM22Q9NW64 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.387e-7■■■■■ 27.3
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RBM22Q9NW64 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 27.3
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RBM22Q9NW64 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.145e-8■■■■■ 27.2
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RBM22Q9NW64 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.062e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.832e-6■■■■■ 27.2
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RBM22Q9NW64 TTC3-223ENST00000492275 769 ntTSL 326.08■■□□□ 1.772e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.62e-6■■■■■ 27.2
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RBM22Q9NW64 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 27.2
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RBM22Q9NW64 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 27.2
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RBM22Q9NW64 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 KPNB1-205ENST00000577918 859 ntTSL 314.84□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 27.2
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RBM22Q9NW64 CNOT10-205ENST00000435630 2290 ntTSL 1 (best)12.64□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 CNOT10-207ENST00000455381 770 ntTSL 510.34□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 TTC3-202ENST00000355666 7712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 TARS-207ENST00000505012 608 ntTSL 49.14□□□□□ -0.955e-12■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 NAA25-207ENST00000551858 2815 ntTSL 1 (best)7.03□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 CNOT10-203ENST00000416457 2096 ntTSL 26.78□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 TTC3-218ENST00000484047 1945 ntTSL 26.5□□□□□ -1.372e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 NAA25-205ENST00000549711 2933 ntTSL 1 (best)5.65□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.565e-7■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.642e-7■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.642e-7■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 KPNB1-204ENST00000577875 605 ntTSL 34.43□□□□□ -1.72e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 NAA25-208ENST00000552527 5815 ntTSL 24.27□□□□□ -1.732e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.822e-7■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.273e-40■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.743e-40■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.518e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 APEH-205ENST00000447436 963 ntTSL 516.42■□□□□ 0.228e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 APEH-204ENST00000446089 855 ntTSL 514.07□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 27.2
RBM22Q9NW64 APEH-214ENST00000482301 1041 ntTSL 313.86□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 27.2
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