Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRT84Q9NSB2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms