Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC4Q9HBW1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms