Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYNCQ9H7C4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms